癌症体细胞非编码突变模式的全基因组分析

2022年04月11日 来源:科学网 作者:小柯机器人

美国哈佛医学院Eliezer M. Van Allen和Felix Dietlein研究组合作取得最新进展。他们对癌症中体细胞非编码突变模式进行了全基因组分析。2022年4月8日,国际知名学术期刊《科学》发表了这一成果。

他们在代表 19 种肿瘤类型的 3949 个全癌症基因组中建立了体细胞突变事件的全基因组概要。蛋白质编码事件捕获了成熟的驱动因素。组织特异性基因附近的非编码事件,例如肝脏中的 ALB 或前列腺中的 KLK3,表征了局部乘客突变模式,并可能反映肿瘤细胞起源印记。调节启动子和增强子区域中的非编码事件经常涉及癌症相关基因,例如 BCL6、FGFR2、RAD51B、SMC6、TERT 和 XBP1,并代表可能的驱动因素。与大多数非编码调控事件不同,XBP1 突变主要在基因启动子之外积累,他们使用 CRISPR 干扰筛选和荧光素酶报告基因分析验证了它们对基因表达的影响。

总的来说,他们的研究为捕获整个基因组的突变事件提供了蓝图,以指导生物发现、治疗和诊断的进展。