新方法有效揭示多种免疫疾病的遗传关联
2022年03月17日 来源:科学网 作者:小柯机器人
英国惠康基金会Nicole Soranzo课题组取得一项新突破。他们的研究利用调节表型相关遗传确定了12种免疫介导疾病因果变异的精细定位。相关论文于2022年3月14日发表在《自然-遗传学》杂志上。
研究人员使用来自BLUEPRINT、GTEx和eQTLGen项目所揭示的调控数量性状基因座(QTL)，精细绘制12种免疫介导疾病的可能因果变异。研究人员确定了340个独特的基因座，它们以高后验概率(≥98%)与调节性QTL共定位，并将贝叶斯统计应用于每个基因座的精细映射关联。研究表明，与疾病汇总统计相比，源自监管QTL的精细映射可信集更小。此外，它们丰富了功能上可解释的候选因果变体和可能的因果插入/缺失(INDEL)多态性。
最后，研究利用大规模平行报告基因分析来评估与炎症性肠病相关ITGA4基因座的候选因果变异。总体而言，该研究结果表明，与疾病相关调控QTL的精细定位可以增强对潜在致病变异的发掘，并增强对潜在致病基因和分子机制的理解。
据了解，揭示遗传变异的因果关系有助于理解疾病生物学。