科学家开发出一种面向分子式的代谢组靶向方法
2021年11月05日 来源:科学网 作者:小柯机器人
西班牙罗维拉·依维尔基里大学Oscar Yanes团队开发出一种面向分子式的代谢组靶向方法。该研究于2021年11月1日在线发表于国际一流学术期刊《自然—方法学》。
研究人员提出了HERMES,一种以分子式为导向的无峰检测方法,它使用原始LC/MS1信息来优化MS2采集。用HERMES研究环境中的水、大肠杆菌和人类血浆提取物,研究人员实现了MS2扫描的生物特异性增加,与最先进的数据依赖采集(DDA)方法相比,导致质谱相似性评分和识别率提高。因此,HERMES提高了敏感性、选择性和代谢物的注释。HERMES是一个R软件包,并且有一个用户友好的图形界面用于数据分析和可视化。
据悉,全面的代谢组分析对生物医学、环境和生物技术研究至关重要。然而,目前基于MS1和MS2的非靶向代谢组学的采集和数据分析策略导致代谢物的低识别率。
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