新方法可测量核糖体的装载时间
2021年09月09日 来源:科学网 作者:小柯机器人
德国海德堡大学Johanna Schott开发出新方法，可用于测量核糖体装载时间并揭示对核糖体密度的动力学影响。相关论文于2021年9月3日在线发表于国际学术期刊《自然—方法学》。
为了测量新生mRNA上的核糖体密度（RD），研究人员将Ribo-Seq与渐进式4-硫代尿苷标记相结合，开发了新生Ribo-Seq。在小鼠巨噬细胞中，研究人员通过实验确定了新生mRNA的出现和它与核糖体结合之间的滞后期，经计算，大量mRNA的滞后期为20-22分钟。在小鼠胚胎干细胞中，nRibo-Seq显示核糖体装载的滞后性更强，达到35-38分钟。
在用脂多糖刺激巨噬细胞后，细胞质和翻译的mRNA之间的滞后导致输入和核糖体保护的片段之间的解耦，这在mRNA数量远离稳态表达的条件下引起扭曲的RD测量。因此，研究人员证明转录变化以一种被动的方式影响RD。
据介绍，一般来说，mRNA被认为在进入细胞质后会立即被核糖体装载。