无成像分子断层扫描实现对空间组织的分析

瑞士洛桑联邦理工学院Gioele La Manno小组通过无成像分子断层扫描实现对空间组织的分析。该研究于2021年4月19日在线发表于国际一流学术期刊《自然—生物技术》。

研究人员描述了一种无需成像的框架，该框架通过将样本切成细条来实现后续的图像重建，从而在组织内定位高通量的读值。研究人员实施了此框架，从而将低输入RNA测序方案转化为无需成像的空间转录组学技术（称为STRP-seq），并通过对小鼠大脑的空间转录组进行分析来对其进行验证。

研究人员将该技术应用于了澳大利亚鬃狮蜥Pogona vitticeps的大脑。研究结果揭示了该蜥蜴端脑的分子解剖学，为爬行动物的皮层和皮下层的明显区域化提供了证据。研究人员认为，STRP-seq可用于从一系列其他组学技术中获得空间分辨的数据。

据悉，目前已经开发了几种用于空间分辨的组学分析的技术，但是每种新方法都需要设置特定的检测策略或专用仪器。