研究发现T细胞特异性的全局分析能够用于抗原发现

美国斯坦福大学Mark M. Davis研究团队发现，人类非小细胞肺癌中共有T细胞特异性的全局分析可实现HLA推测和抗原发现 。2021年3月9日，国际知名学术期刊《免疫》发表了这一成果。

为了鉴定具有共享抗原特异性的疾病相关T细胞受体（TCR），研究人员使用GLIPH2（grouping of lymphocyte interactions with paratope hotspots 2）算法分析了178名非小细胞肺癌患者的778,938个TCRβ链序列。研究人员确定了超过66,000个共有特异性组，其中435个与相邻肺相比在克隆中扩展并富集了肿瘤。使用酵母多肽-HLA A*02:01展示文库，研究人员鉴定了一组富集肿瘤特异性的抗原表位。这其中包括一条来自上皮蛋白TMEM161A的多肽，这个多肽在肿瘤中过表达并且是爱泼斯坦-巴尔病毒和大肠杆菌的交叉反应性抗原决定簇。

这些发现表明，这种交叉反应可能是肿瘤浸润中病毒特异性T细胞存在的基础，而病原体交叉反应可能是多种癌症的特征。这项工作中产生的方法和分析流程，以及此处定义的特异性组别，为理解癌症中的T细胞反应提供了一种资源。