科学家绘制出地球微生物组的基因组图谱

美国能源部联合基因组研究所Emiley A. Eloe-Fadrosh小组绘制出地球微生物组的基因组图谱。该项研究成果于2020年11月9日在线发表在《自然—生物技术》杂志上。

据研究人员介绍，从霰弹枪法元基因组中重建的细菌和古细菌基因组使人们对生态学以及与环境和宿主相关微生物群落的进化有了深入的了解。

研究人员将这种方法应用于从地球各大洲和海洋不同栖息地收集的10,000多个基因组，包括来自人和动物宿主、工程环境以及天然和农业土壤的基因组，从而获得了现有微生物的、代谢的以及功能性的潜在资源。

该综合目录包括52,515个由元基因组组装的基因组，它们代表了跨越135个门的12,556个新的候选物种分类单位。该目录将已知细菌和古细菌的系统发育多样性扩展了44％，可广泛用于简化的比较分析、交互式探索、代谢建模和批量下载。

研究人员展示了此集合的实用性，可用于了解次级代谢物的生物合成潜力以及解析大量与无法培养型病毒的宿主联系。该资源强调了以基因组为中心的方法在揭示影响生态系统的无法培养型微生物的基因组特质方面的价值。