科学家绘制出患者来源肿瘤异种移植物在传代过程中拷贝数保守性的分析图谱
2021年01月12日 来源:科学网 作者:小柯机器人
美国杰克逊实验室Jeffrey H. Chuang等研究人员合作绘制了患者来源肿瘤异种移植物在传代过程中拷贝数保守性的分析图谱。 这一研究成果发表在2021年出版的国际学术期刊《自然—遗传学》上。
研究人员详尽地分析了1,451个患者来源异种移植物（PDX）和509个PDX模型中匹配的患者肿瘤（PT）样本中的拷贝数变化（CNA）。与基于基因表达的推断相比，基于DNA测序和微阵列数据的CNA推断显示出更高的分辨率和动态范围，并且它们还显示了从PT到后期传递PDX的强大CNA保守性。对130个结直肠癌和PT PDX早期/PDX晚期三联症的CNA复发分析证实了高分辨率的CNA保留。
研究人员没有观察到不同模型在PDX特异性CNA中癌症相关基因的显著富集。此外，患者和PDX肿瘤之间的CNA差异可与患者内多区域样本的差异相媲美。
这项研究表明，小鼠宿主不会驱动PDX的系统拷贝数进化。
据介绍，PDX是切除的人类肿瘤，然后被植入小鼠体内进行临床前研究和治疗测试。有研究已经提出，小鼠宿主会影响PDX植入和繁殖期间的肿瘤进化，从而影响人类癌症PDX建模的准确性。